マットからコーディに、メッセージが届（とど）いた──「助けてくれ！　はめられた！」。学校の前庭に設置（せっち）されたマスコット「バークマー」を盗（ぬす）んだ犯人にされ、停学（てい・がく）になってしまったという。暗号クラブは、真犯人（しん・はん・にん）をつきとめるため、調査を開始する！ところが、次の事件（じ・けん）が起こってしまい──!?エム・イーが一目ぼれする新キャラも登場！第一章　消えた学校マスコット　12第二章　事(じ)件(けん)発生！　31第三章　カフェテリアの指(し)紋(もん)　47第四章　捕(ほ)虜(りょ)救(きゅう)出(しゅつ)作(さく)戦(せん)　73第五章　マット、ピンチにおちいる　93第六章　トランプに聞いてみろ　114第七章　疑(ぎ)惑(わく)の教(きょう)師(し)　140第八章　尾(び)行(こう)　158第九章　だれのしわざ？　182第十章　シェイド先生の秘(ひ)密(みつ)　204第十一章　真相（しん・そう）--そして新たな暗号 226